北海道大学出版会遺伝子デザイン学入門 Ⅰ [978-4-8329-7413-5]

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遺伝子デザイン学入門 Ⅰ ― かんたんデザイン編
山崎　健一・伊藤　健史著

判型：四六並製
頁数： 134
ISBN： 978-4-8329-7413-5
Cコード： C1047
発行日：2012-11-15
定価： 1,650円（本体価格1,500円＋税）

在庫あり

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●本書の特徴

高校で生物学をきちんと勉強した学生なら理解できるように書かれた入門書。①大学生の独学用テキストとして，②教師の講義ノートとして，③研究者・技術者の入門書として，④「生物ロボットコンテスト」への参加に挑戦してみたいという学生たちのグループ学習用テキストとして最適。

●版元から

2010年，北大の学部生チームを編成し，iGEM(生物ロボットコンテスト)2010(於：米国マサチューセッツ工科大学)への参加に挑戦し始めた。この時，この国際大会への各国からの参加チームが標準として用いている遺伝子作製技術が，工学原理に基づいて構築されており，これに用いる遺伝子部iが質的にも量的にもすぐれていることを知った。これなら，大学の１年生にも習得可能と考え，2011年度，北大理系の新入生を対象として開講されている一般教育演習(フレッシュマンセミナー)のメニューのひとつとして「遺伝子デザイン学入門」を開講した。課題として学生がデザインした遺伝子は，どれも個性豊かで若者らしい創造性に富んだものばかりであった。この講義を通じて，「従来，経験値の高い研究者にしか手の届かなかった遺伝子デザインというものも，遺伝子部品と遺伝子部品情報のインフラを整備し，単純化した方法を確立することにより，経験の浅いまたは全く経験のな学部生にも“手の届く技術”に進化させることは可能であり，その知識を，講義を通じて３０時間程度で伝授できること」を確信することができた。
本書はこの講義用テキストをもとに，学生やほかの教師のみなさんのコメントを取り入れ修正したものである。高校で生物学をちゃんと勉強した学生なら理解できる内容表現となっている。
読者対象と読書目的は，①遺伝子デザインに興味を持っている学生の独学用テキストとして，②遺伝子デザイン法を教育したいという大学の教師の講義ノートとして，③これから遺伝子デザイン法を学びたいという研究者・技術者の入門書として，④iGEMチームに参加して「生物ロボットコンテスト」への参加に挑戦してみたいという学部生のグループ学習用テキストとしてなど，を想定している。

●目次

まえがき　　
序　　章　　
第1章　遺伝子デザイン　　
　1.1　従来の遺伝子組換え技術による部品の選択と連結　　
　1.2　工学原理に基づく遺伝子デザイン　　
　　　工学原理に基づく遺伝子デザインとは何か　/工学原理に基づく遺伝子部品の選択　/工学原理に基づく遺伝子配列情報の連結　
第2章　遺伝子各部位の配置・役割・構造　　
　2.1　遺伝子各部位の配置と役割　　
　　　プロモーター領域(コアプロモーター領域と転写調節領域)　/転写開始部位　/非翻訳領域　/翻訳開始部位　/タンパク質コード領域　/細胞内器官への局在化シグナル　/タンパク質ドメイン　/翻訳終結部位　/非翻訳領域　/転写終結部位　
　2.2　遺伝子部品の形　　
　　　 TATAボックス配列から転写開始部位　/転写調節領域のシスエレメント　/転写開始部位から翻訳開始部位　/タンパク質コード領域　/シグナルペプチド配列　/翻訳終結部位　/ポリA付加シグナル部位　/転写終結部位　
第3章　遺伝子部品をつないで遺伝子を組立てる　　
　3.1　遺伝子を組立てる　　
　　　遺伝子部品の形　/ふたつのGenPartsの連結　
　3.2　生物デバイス(BioDevices)とは　　
　3.3　デザインに基づいて遺伝子を構築する　　
　　　遺伝子部品を含むDNA断片の増幅に利用するPCRとは　/遺伝子部品の加工に用いる制限酵素とは　/遺伝子部品とベクターとの連結に用いるDNAリガーゼとは　
第4章　生物デバイスと生物デバイスドライバー　　
　4.1　生物デバイスドライバーとは　　
　　　生物デバイス情報の発現には遺伝子系(生物デバイスドライバー)が必要　/生物デバイスドライバーと最小ゲノム　/個々の生物デバイスの設計からゲノム合成に至る道筋　
　4.2　天然および人工の生物デバイスドライバー　　
　　　地球型生物の生物デバイスドライバー　/人工生物の生物デバイスドライバー　/人工生物との共存　
第5章　生物デバイス　　
　5.1　生物と生物デバイス　　
　5.2　生物と最小ゲノム　　
　5.3　最小ゲノムを構成する5つのコア生物デバイス群情報　
　　　生物デバイスドライバー　/多様な分子を生合成する生物デバイス群　/エネルギー分子を生合成する生物デバイス群　/自己複製のための生物デバイス群　/環境応答のための生物デバイス群　
　5.4　アクセサリー生物デバイス群　　
　　　細菌の運動に必要な生物デバイス群　/細菌の生体防御をする生物デバイス群　/細菌の新資源を活用する生物デバイス群　/微生物の環境適応に必要な生物デバイス群　
第6章　植物で機能する生物デバイスの実例　　
　6.1　植物でバイオセンサーを作る　　
　6.2　植物に生物デバイスを導入してバイオセンサーを作る　
　6.3　植物に導入する生物デバイスのコンセプトデザイン　
　6.4　生物デバイス情報の植物への導入　　
　6.5　植物に導入する生物デバイス情報作りに必要な遺伝子部位　　
　6.6　ステロイドホルモンの存在を検知し，青く変化する植物バイオセンサー　　
第7章　遺伝子デザインツール　　
　7.1　遺伝子デザインツール「UGENE」とは　　
　　　 UGENEのインストール　/UGENEの起動　/新規プロジェクトの作成　/遺伝子部品情報(GenBank形式)のダウンロード　/.gbファイルのProjectへの読み込み　
　7.2　遺伝子部品配列情報を作成する　　
　　　遺伝子部品コア配列情報を準備する　/遺伝子配列にプレフィックス配列(共通上流配列)とサフィックス配列(共通下流配列)を連結して遺伝子部品配列情報を作成　/切断に利用する制限酵素認識配列の設定　/GenPartsのプレフィックスとサフィックスの配列を遺伝子部品コア配列の両端に連結する　
　7.3　遺伝子部品配列情報の制限酵素処理シミュレーション　
　7.4　制限酵素処理後の遺伝子部品配列情報の連結シミュレーション　　
第8章　「遺伝子をデザインする」とはどういうことか　　
　8.1　遺伝子部品の役割を単文で表現　　
　8.2　ひとつの人工遺伝子を短い文章で表現　　
　8.3　複数遺伝子からなる人工生物デバイスを短い物語で表現
　8.4　生物個体の各器官の機能は長い物語　　
　8.5　魅力的な生物デバイスの構築には多くの知識と創造性が不可欠　　
　8.6　生物デバイスの例を学ぶ　　
総合問題　　
あとがき　　
索　　引　　

●著者紹介

山崎　健一（ヤマザキ　ケンイチ）

伊藤　健史（イトウ　タケシ）

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